台灣房地合一稅從2016年1月1日起上路，近幾年個人買賣房屋獲利，依據持有的年數，會分成四種級距，課徵15%（持有超過10年）、20%（持有2~10年）、35%（持有1~2年）或45%（持有短於1年）所得稅。採分離課稅，所有權完成移轉登記之次日起算30天內申報納稅。

台灣國稅局官員表示，然而依據《所得稅法》第24-5條規定，「外商在台灣境內所設的分公司」，如果名下的不動產適用房地合一新制，交易不動產所得要適用特別稅率：即，持有期間在一年以內者，稅率為45%；持有期間超過一年以上者，稅率為35%。

換句話說，外商分公司買賣不動產所課徵的房地合一稅，跟一般個人的四級稅率類似，但是只取最高二個級距課稅，即便持有房地期間超過十幾年，依然要課35%房地合一稅。

由於可能會有外國的投資客，透過直接買公司股權的方式，來達到取得或出售不動產的目的，台灣國稅局官員特別提醒，依據所得稅法同一條規定，當外商交易持股過半的海外公司股權，但是這間海外公司的股權價值有50%以上是由台灣境內的不動產構成，那這筆海外股權交易，對台灣的國稅局而言，也會視為房地合一稅的課稅對象，同樣要以股權交易所得額來計算課徵房地合一稅。

台灣國稅局官員表示，這項規定主要是針對外商分公司而訂，或是在台灣沒有營業場所，平常是透過物流業者、會計師事務所代理報稅的外商，也同樣適用。

國稅局官員說，若是外商來台設立的子公司，就算是獨立個體，課稅方式就會視為國內企業，不動產交易所得直接併入年度營利事業所得額，依20%稅率課稅。