在台湾经营公司，若初期几年为亏损时不用缴税，待获利时，初期几年的亏损，并不一定可以拿来做亏损抵扣。这与其他地区的规定不太相同。

要符合亏损抵扣，需要做到以下四件事：
一、符合公司或组织之营利事业身分;
二、如期申报;
三、完善会计账簿;
四、亏损以及获利的年度都有委任会计师签证。

针对如期申报，站在台湾税务部门的立场，是包括如期申报及如期缴纳。

最近有个例子，A公司2022年度本业亏损，但有出售不动产赚了台币(以下同)100万多元，房地合一税29万多元。依规定合并报缴后，扣除扣缴税款20万多元后，自缴税额9万多元。2023年6月30日完成了网络申报，但迟至7月1日才缴纳税款。

这个差一天缴税的例子，因未如期申报缴纳，A公司2022年度营所税申报案件，由会计师查核签证案件，将会被台湾税务部门打成普通申报案件。影响的是，2022年度的本业亏损，无法于未来十年抵减。

虽然，曾有最高行政法院2020年度上字第632号判决，认为税法对申报和缴税各有规定，应该是两件事，无法解释如期申报包括缴税，但台湾税务部门对最高行政法院的判决提起上诉中，他们认为必须「报缴合一」，一直以来都是这个原则在做申报及缴税。

A公司为什么会犯了这种错误呢？根据诉愿书的陈述，A公司以为2023年6月30日是截止日期是针对营所税，而房地合一税是另一个税目，不适用营利事业所得税的报缴截止日。但其实房地合一税并没有一部单独的税法，而是订在所得税中。只是个人和公司的报缴方式不同。就如一般在讲的囤房税，也并不是新的税目，它就是房屋税。

而在个人申报时，房地合一税是分开报缴，在交易后三十日内要完成报缴；个人综所税则是在每年5月报缴，报缴时间不一样，不容易弄错。

但公司是营利事业所得税、房地合一税合并报缴，都在5月一起但分开计税。

因此，公司发生房地产交易时，需要特别小心的应对，最好委任启源协助，避免因小失大。